Là một loại công ty mà sự liên hệ giữa các thành viên rất gắn bó, không chỉ về quyền lợi mà còn vì quy chế liên đới trách nhiệm, Luật Doanh nghiệp dành cho công ty hợp danh quyền tự chủ rất lớn trong việc tổ chức quản lý doanh nghiệp. Điều lệ công ty có vai trò quan trọng. Điều lệ chính là thỏa thuận của các thành viên căn cứ vào điều kiện, ngành nghề kinh doanh của công ty mà quy định cụ thể cơ chế hoạt động của công ty trong khuôn khổ pháp luật. Luật Doanh nghiệp đưa ra những quy định cơ bản mà các công ty hợp danh phải tuân thủ, bao gồm những quy định về Hội đồng thành viên, về đại diện cho công ty, về Giám đốc. về những vấn đề khác, các thành viên công ty có thể thỏa thuận đưa vào Điều lệ. Điều lệ của công ty khi được đăng ký tại cơ quan đăng ký kinh doanh có giá trị là một nguồn quy định điều chỉnh hoạt động của công ty hợp danh. Hội đồng thành viên Hội đồng thành viên bao gồm tất cả thành viên, là cơ quan quyết định cao nhất của công ty. Hội đồng thành viên quyết định về tất cả các hoạt động của công ty trong các kỳ họp thông qua biểu quyết. Khi biểu quyết, trừ trường hợp Điều lệ có quy định khác, mỗi thành viên hợp danh có một phiếu biểu quyết có giá trị như nhau, không phụ thuộc vào mức vốn góp vào công ty. Thành viên góp vốn có quyền tham gia biểu quyết về những vấn đề quan trọng của công ty như sửa đổi, bổ sung Điều lệ của công ty, tổ chức lại, giải thể công ty và những vấn đề khác liên quan đến quyền lợi và nghĩa vụ của họ với số phiếu do Điều lệ công ty quy định. Thành viên hợp danh có quyền yêu cầu triệu tập họp Hội đồng thành viên để thảo luận và quyết định công việc kinh doanh của công ty. Thành viên yêu cầu triệu tập họp phải chuẩn bị nội dung, chương trình và tài liệu họp. Chủ tịch Hội đồng thành viên có thể triệu tập họp Hội đồng thành viên khi xét thay cần thiết hoặc theo yêu cầu của thành viên hợp danh. Trường hợp Chủ tịch Hội đồng thành viên không triệu tập họp theo yêu cầu của thành viên hợp danh thì thành viên đó triệu tập họp Hội đồng thành viên. Tham khảo dịch vụ thành lập công ty nước ngoài trọn gói. Đối với những vấn đề quan trọng theo quy định tại Điều 135 Khoản 3 Luật Doanh nghiệp, Nghị quyết của Hội đồng thành viên có giá trị khi được ít nhất ba phần tư tổng số thành viên hợp danh biểu quyết tán thành. Đó là những vấn đề quan trọng như: phương hướng phát triển công ty; sửa đổi, bổ sung Điều lệ công ty; tiếp nhận thêm thành viên hợp danh mới; chấp nhận thành viên hợp danh rút khỏi công ty hoặc quyết định khai trừ thành viên; quyết định dự án đầu tư; quyết định việc vay và huy động vốn dưới hình thức khác, cho vay với giá trị bằng hoặc lớn hơn 50% vốn điều lệ của công ty, trừ trường hợp Điều lệ công ty quy định một tỷ lệ khác cao hơn; quyết định mua, bán tài sản có giá trị bằng hoặc lớn hơn vốn điều lệ của công ty, trừ trường hợp Điều lệ công ty quy định một tỷ lệ khác cao hơn; quyết định thông qua báo cáo tài chính hàng năm, tổng số lợi nhuận được chia và số lợi nhuận chia cho từng thành viên; quyết định giải thể công ty. Để đảm bảo tính công khai, loại trừ tranh chấp, tất cả các quyết định của Hội đồng thành viên phải được ghi vào sổ biên bản của công ty và phải được lưu giữ tại trụ sở chính của công ty. Công ty có thể tiếp nhận thêm thành viên hợp danh hoặc thành viên góp vốn. Việc tiếp nhận thành viên mới của công ty phải được Hội đồng thành viên chấp thuận. Thành viên hợp danh hoặc thành viên góp vốn phải nộp đủ so von cam kết góp vào công ty trong thời hạn mười lăm ngày kể từ ngày được chấp thuận, trừ trường hợp Hội đồng thành viên quyết định thời hạn khác. Thành viên hợp danh mới phải cùng liên đới chịu trách nhiệm bằng toàn bộ tài sản của mình đối với các khoản nợ và nghĩa vụ tài sản khác của công ty, trừ trường hợp thành viên đó và các thành viên còn lại có thoả thuận khác. Chủ tịch Hội đồng thành viên, Giám đốc hoặc Tổng giám đốc công ty Hội đồng thành viên bầu một thành viên hợp danh làm Chủ tịch Hội đồng thành viên, đồng thời kiêm Giám đốc hoặc Tổng giám đốc công ty nếu Điều lệ công ty không có quy định khác. Chủ tịch Hội đồng thành viên, Giám đốc hoặc Tổng giám đốc có các nhiệm vụ quy định tại Điều 137 Khoản 4 Luật Doanh nghiệp: a) Quản lý và điều hành công việc kinh doanh hàng ngày của công ty với tư cách là thành viên hợp danh; b) Triệu tập và tổ chức họp Hội đồng thành viên; ký các quyết định hoặc nghị quyết của của Hội đồng thành viên; c) Phân công, phối hợp công việc kinh doanh giữa các thành viên hợp danh; ký các quyết định về quy chế, nội quy và các công việc tổ chức nội bộ khác của công ty; d) Tổ chức sắp xếp, lưu giữ đầy đủ và trung thực sổ kế toán, hoá đơn, chứng từ và các tài liệu khác của công ty theo quy định của pháp luật; đ) Đại diện cho công ty trong quan hệ với cơ quan nhà nước; đại diện cho công ty với tư cách là bị đơn hoặc nguyên đơn trong các vụ kiện, tranh chấp thương mại hoặc các tranh chấp khác; e) Các nhiệm vụ khác do Điều lệ công ty quy định. Quyền điều hành, quản lý hoạt động công ty của các thành viên hợp danh Tất cả các thành viên hợp danh đều có quyền đại diện cho công ty trong đàm phán ký kết hợp đồng để thực hiện các công việc được giao; đều đại diện cho công ty trước pháp luật và cơ quan nhà nước trong phạm vi ngành nghề kinh doanh đã đăng ký. Tất cả các thành viên hợp danh đều tham gia đảm nhiệm các chức trách quản lý và kiểm soát trong công ty, đều được sử dụng con dấu, tài sản của công ty để hoạt động kinh doanh các ngành, nghề kinh doanh đã đăng ký. Khi nhân danh công ty thực hiện các công việc được giao, thành viên hợp danh phải làm việc một cách trung thực, không trái với Điều lệ, các quyết định của Hội đồng thành viên. Do phải chịu trách nhiệm bằng toàn bộ tài sản của mình nên các thành viên hợp danh không được đồng thời là thành viên của một công ty hợp danh khác hoặc chủ sở hữu của một doanh nghiệp tư nhân, trừ trường hợp được các thành viên hợp danh khác đồng ý. Để tránh việc lạm dụng vị trí để trục lợi riêng không có lợi cho công ty, thành viên hợp danh không được tự mình hoặc nhân danh người thứ ba thực hiện hoạt động kinh doanh trong cùng ngành, nghề kinh doanh của công ty. Thành viên hợp danh không được lạm dụng quy định cho phép đại diện cho công ty để ký kết hợp đồng nhân danh công ty nhưng xác lập và thực hiện các giao dịch khác nhằm thu lợi riêng cho cá nhân và cho người khác. Trong công ty hợp danh, các thành viên góp vốn không được tham gia quản lý công ty, không được hoạt động nhân danh công ty. Những quy định về việc thành lập công ty mới, các quyền và nghĩa vụ của tổ chức quản lý trong công ty hợp danh được quy định rõ trong Luật Doanh Nghiệp 2020.
Hội đồng thành viên Hội đồng thành viên bao gồm tất cả thành viên, là cơ quan quyết định cao nhất của công ty. Hội đồng thành viên quyết định về tất cả các hoạt động của công ty trong các kỳ họp thông qua biểu quyết. Khi biểu quyết, trừ trường hợp Điều lệ có quy định khác, mỗi thành viên hợp danh có một phiếu biểu quyết có giá trị như nhau, không phụ thuộc vào mức vốn góp vào công ty. Thành viên góp vốn có quyền tham gia biểu quyết về những vấn đề quan trọng của công ty như sửa đổi, bổ sung Điều lệ của công ty, tổ chức lại, giải thể công ty và những vấn đề khác liên quan đến quyền lợi và nghĩa vụ của họ với số phiếu do Điều lệ công ty quy định. Thành viên hợp danh có quyền yêu cầu triệu tập họp Hội đồng thành viên để thảo luận và quyết định công việc kinh doanh của công ty. Thành viên yêu cầu triệu tập họp phải chuẩn bị nội dung, chương trình và tài liệu họp. Chủ tịch Hội đồng thành viên có thể triệu tập họp Hội đồng thành viên khi xét thay cần thiết hoặc theo yêu cầu của thành viên hợp danh. Trường hợp Chủ tịch Hội đồng thành viên không triệu tập họp theo yêu cầu của thành viên hợp danh thì thành viên đó triệu tập họp Hội đồng thành viên.
